知网查重是指利用知网平台进行文献查重，主要用于检测学术论文的原创性和重复率。知网查重系统通过比对文本内容，分析相似度，并生成查重报告。而中科院查重则是指中国科学院开发的一款查重软件，具有较高的查重准确度和稳定性。两者在查重原理、算法和使用方式上都存在一定差异，用户可以根据需求选择合适的查重工具。

知网查重与中科院查重在查重准确度和速度上有所不同。知网查重系统侧重于快速查重，适用于普通用户的日常文献查重需求；而中科院查重在准确度上更胜一筹，适合对文献查重要求较高的科研人员和学者使用。另外，中科院查重还具有一定的学科领域适配性，能够更好地满足不同学科的查重需求。